SKUARCH

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Para poder cargar dll's en java se puede tener varios caminos como puede ser

System.loadLibrary("d:\\directoryX\\subDirY\\MyDll.dll")

ó

System.load("d:\\directoryX\\subDirY\\MyDll.dll");

utilizando la clase Runtime

Runtime.getRuntime().load("d:/directoryX/subDirY/MyDll.dll");

especificando a la jvm

java -Djava.library.path=c:/temp JNIJavaHowTo

y la exception que se lanza es java.lang.UnsatisfiedLinkError

fuente
http://www.rgagnon.com/javadetails/java-0318.html